自2007年以来，先后有7套全光谱水质自动分析仪分别通过长江水利委员会水文局和长委水资源保护局在长江流域的水质自动监测站投入监测。
长江中游武汉水文站项目：NTU, CODmn, TOC, NO3
长江上海-武汉-重庆断面流动监测项目：NTU, CODmn, TOC, NO3
长江流域省界断面自动水质监测项目： CODmn
四川重庆断面：四川嘉陵江武胜水质自动监测站
陕西湖北断面：陕西安康市百河水质自动监测站
河南湖北断面：河南安阳淅川县紫荆关镇水文站
湖南贵州断面：贵州天柱县白市镇沅江自动监测站：浮标站
湖南贵州断面：贵州玉屏县大龙镇崇滩自动监测站